Я несколько раз нападал на флагманы рисовашек, они все как один стреляют по самым многочисленным группам. Неважно сколько мелочи летят с ними. Всегда стреляют по основам флота.
Как я понимаю подобная опция уже есть, осталось предложить эту опцию игрокам. Перед стартом, предлагаю добавить опцию, по каким кораблям стрелять в первую очередь, флагманы или тяжи, или мелочь вроде истребителя.
И еще, флагманы слишком большие, и если с ними есть другие корабли, очень легко перепутать цель, и отдать неверный приказ, и потерять драгоценное время, а вместе с этим и немного флота.